BTAF1 - BTAF1

BTAF1
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	BTAF1, MOT1, TAF (II) 170, TAF172, TAFII170, B-TFIID TATA-қорапты байланыстыратын ақуыз 1-фактор
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 605191 MGI: 2147538 HomoloGene: 31978 Ген-карталар: BTAF1
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	10-хромосома (адам)
Соңы	92,030,325 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	19-хромосома (тышқан)
Соңы	37,012,752 bp
РНҚ экспрессиясы өрнек
	Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Гендік онтология
Молекулалық функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНҚ байланыстыратын транскрипция факторының белсенділігі; • ДНҚ байланыстыру; • нуклеотидті байланыстыру; • гидролаза белсенділігі; • ATP байланысы; • GO: 0008026 геликаза белсенділігі; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы;
Ұялы компонент	• жасушаішілік мембранамен шектелген органоид; • жасуша ядросы; • нуклеоплазма;
Биологиялық процесс	• транскрипцияның теріс реттелуі, ДНҚ-шаблонмен; • хроматинмен байланысудың теріс реттелуі;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	9044
	107182
	ENSG00000095564
	ENSMUSG00000040565
	O14981; Q2M1V9
	E9QAE3
	NM_003972
	NM_001080706
	NP_003963; NP_003963.1
	NP_001074175
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

TATA-мен байланысатын ақуызға байланысты фактор 172 Бұл ақуыз адамдарда кодталған BTAF1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Транскрипцияны РНҚ-полимераза II-мен бастау үшін TATA қорапты байланыстыратын ақуыздың (TBP; MIM 600075) және TBP-мен байланысты факторлардың немесе TAFs-тің (мысалы, TAF2B; MIM 604912) 2 түрлі кешендерде TFIID және B-TFIID көмегі қажет. TFIID кешені TBP және 8-ден астам TAF-тен тұрады. Алайда TBP-нің көп бөлігі BP-TFIID кешенінде бар, ол TBP және TAFII170-тен тұрады, сонымен қатар TAF172 деп аталады және ДНҚ-ға тәуелді ATPase белсенділігіне ие. [OMIM жеткізген]^[7]

Өзара әрекеттесу

BTAF1 көрсетілді өзара әрекеттесу бірге TATA байланыстыратын ақуыз.^[6]^[8]

Әдебиеттер тізімі

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000095564 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040565 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (желтоқсан 1997). «B-TFIID транскрипция факторының TATA байланыстыратын протеинмен байланысты факторII170 суббірлігі үшін cDNA клондауы ашытқы мен дрозофиладағы ғаламдық транскрипция реттегіштерінің гомологиясын анықтайды». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. дои:10.1073 / pnas.94.22.11827. PMC 23617. PMID 9342322.
^ ^а ^б Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (наурыз 1998). «TAF-172 клондау және биохимиялық сипаттамасы, ашытқы Mot1 адам гомологы». Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. дои:10.1128 / MCB.18.3.1701. PMC 108885. PMID 9488487.
^ ^а ^б «Entrez Gene: BTAF1 BTAF1 РНҚ-полимераза II, B-TFIID транскрипциясы факторымен байланысты, 170кДа (Mot1 гомолог, S. cerevisiae)».
^ Скаллли Р, Андерсон СФ, Чао Д.М., Вей В, Е Л, Янг РА, Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (мамыр 1997). «BRCA1 - РНҚ полимераза II холоферментінің құрамдас бөлігі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (11): 5605–10. дои:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.

Сыртқы сілтемелер

Адам BTAF1 геномның орналасуы және BTAF1 геннің егжей-тегжейлі беті UCSC Genome Browser.

Әрі қарай оқу

Чжоу Q, Sharp PA (1995). «ВИЧ-1 Татпен реттелудің жаңа механизмі және факторы». EMBO J. 14 (2): 321–8. дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x. PMC 398086. PMID 7835343.
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). «LBP-1-дің жаңа репликасы, in vitro созылу деңгейінде АИВ-1 транскрипциясын шектеу». Дж.Биол. Хим. 270 (5): 2274–83. дои:10.1074 / jbc.270.5.2274. PMID 7836461.
Ou SH, Гарсия-Мартинес Л.Ф., Польссен Э.Дж., Гайнор РБ (1994). «Адамның иммунодефицит вирусының 1 типті TATA элементі функциясындағы қораптағы E қораптарының мотивтерінің рөлі». Дж. Вирол. 68 (11): 7188–99. дои:10.1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994. PMC 237158. PMID 7933101.
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). «Адамның TFIID-тің ВИЧ-1 трансактиваторы татпен тікелей өзара әрекеттесуі». Табиғат. 367 (6460): 295–9. дои:10.1038 / 367295a0. PMID 8121496. S2CID 4362048.
Ванг З, Моррис Г.Ф., Райс AP, Xiong W, Моррис CB (1996). «Адамның иммунодефицит вирусының 1 типтегі жабайы типті және трансактивация-ақаулы мутанттары Tat протеині адамның TATA байланыстыратын протеинін in vitro байланыстырады». Дж. Сатып алу. Иммундық тапшылық. Синдр. Хум. Ретровирол. 12 (2): 128–38. дои:10.1097/00042560-199606010-00005. PMID 8680883.
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). «ТБП-нің карбокси-терминал аймағындағы мутациялар адамның иммундық тапшылық вирусының 1 типті толық және қысқа транскрипттерінің синтезіне әсер етеді». Дж. Вирол. 70 (8): 5025–34. дои:10.1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996. PMC 190456. PMID 8764009.
Кашанчи Ф, Хлейф С.Н., Дювалль Дж.Ф., Садайе М.Р., Радонович М.Ф., Чо М, Мартин М.А., Чен С.Я., Вайнманн Р., Брэди Дж.Н. (1996). «1 типті адамның иммундық тапшылық вирусының TFIID бірегей учаскесімен өзара әрекеттесуі Dr1 теріс кофакторын тежейді және TFIID-TFIIA кешенін тұрақтандырады». Дж. Вирол. 70 (8): 5503–10. дои:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
Чжоу Q, Sharp PA (1996). «Tat-SF1: ВИЧ-1 Tat арқылы транскрипциялық созылуды ынталандыратын кофактор». Ғылым. 274 (5287): 605–10. Бибкод:1996Sci ... 274..605Z. дои:10.1126 / ғылым.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Гарсия-Мартинес Л.Ф., Иванов Д, Гайнор Р.Б. (1997). «Таттың тазартылған ВИЧ-1 және ВИЧ-2 транскрипциясын алдын-ала бастау кешендерімен қауымдастығы». Дж.Биол. Хим. 272 (11): 6951–8. дои:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID 9054383.
Scully R, Андерсон SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). «BRCA1 - РНҚ полимераза II холоферментінің құрамдас бөлігі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (11): 5605–10. дои:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
Van Der Knaap JA, Van Den Boom V, Kuipers J, Van Eijk MJ, Van Der Vliet PC, Timmers HT (2000). «Адамның TATA-байланыстыратын-ақуызға байланысты факторының гені (TAFII) 170: құрылымы, промоторы және хромосомалық оқшаулауы». Биохимия. Дж. 345 (3): 521–7. дои:10.1042/0264-6021:3450521. PMC 1220786. PMID 10642510.
Вадхва Р, Ягучи Т, Хасан М.К., Тайра К, Каул СК (2003). «Морталин-МПД (мевалонат пирофосфаты декарбоксилаза) өзара әрекеттесуі және олардың жасушалық пролиферацияны басқарудағы рөлі». Биохимия. Биофиз. Res. Коммун. 302 (4): 735–42. дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00226-2. PMID 12646231.
Перейра Л.А., Клейман М.П., Рульманн С, Кавелаарс Ф, Оулад-Абделгани М, Тиммерс Х., Шульц П (2004). «B-TFIID базальды транскрипция факторының молекулалық архитектурасы». Дж.Биол. Хим. 279 (21): 21802–7. дои:10.1074 / jbc.M313519200. PMID 14988402.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). «HeLa жасушаларының ядролық фосфопротеидтерінің ауқымды сипаттамасы». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 101 (33): 12130–5. Бибкод:2004PNAS..10112130B. дои:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Klejman MP, Pereira LA, van Zeeburg HJ, Gilfillan S, Meisterernst M, Timmers HT (2004). «NC2α BTAF1-мен өзара әрекеттеседі және оның ATP-тәуелді ассоциациясын TATA байланыстыратын протеинмен ынталандырады». Мол. Ұяшық. Биол. 24 (22): 10072–82. дои:10.1128 / MCB.24.22.10072-10082.2004. PMC 525489. PMID 15509807.
Grob P, Cruse MJ, Inouye C, Peris M, Penczek PA, Tjian R, Nogales E (2006). «Адамның TFIID-ті крио-электронды микроскоппен зерттеу: гендік реттеуші белгілерді интеграциялау кезіндегі конформациялық тыныс алу». Құрылым. 14 (3): 511–20. дои:10.1016 / j.str.2005.11.020. PMID 16531235.

Бұл мақала а ген қосулы адамның хромосомасы 10 Бұл бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000095564 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040565 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[pmid9342322-5] van der Knaap JA, Borst JW, van der Vliet PC, Gentz R, Timmers HT (желтоқсан 1997). «B-TFIID транскрипция факторының TATA байланыстыратын протеинмен байланысты факторII170 суббірлігі үшін cDNA клондауы ашытқы мен дрозофиладағы ғаламдық транскрипция реттегіштерінің гомологиясын анықтайды». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (22): 11827–32. дои:10.1073 / pnas.94.22.11827. PMC 23617. PMID 9342322.

[pmid9488487-6] а ^б Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (наурыз 1998). «TAF-172 клондау және биохимиялық сипаттамасы, ашытқы Mot1 адам гомологы». Mol Cell Biol. 18 (3): 1701–10. дои:10.1128 / MCB.18.3.1701. PMC 108885. PMID 9488487.

[entrez-7] а ^б «Entrez Gene: BTAF1 BTAF1 РНҚ-полимераза II, B-TFIID транскрипциясы факторымен байланысты, 170кДа (Mot1 гомолог, S. cerevisiae)».

[pmid9159119-8] Скаллли Р, Андерсон СФ, Чао Д.М., Вей В, Е Л, Янг РА, Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (мамыр 1997). «BRCA1 - РНҚ полимераза II холоферментінің құрамдас бөлігі». Proc. Натл. Акад. Ғылыми. АҚШ. 94 (11): 5605–10. дои:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]