NUBPL - NUBPL

NUBPL
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарNUBPL, C14orf127, IND1, huInd1, нуклеотидті байланыстыратын ақуыз, MC1DN21
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 613621 MGI: 1924076 HomoloGene: 11854 Ген-карталар: NUBPL
Геннің орналасуы (адам)
14-хромосома (адам)
Хр.14-хромосома (адам)[1]
14-хромосома (адам)
NUBPL үшін геномдық орналасу
NUBPL үшін геномдық орналасу
Топ14q12Бастау31,489,956 bp[1]
Соңы31,861,224 bp[1]
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001201573
NM_001201574
NM_025152

NM_029760

RefSeq (ақуыз)

NP_001188502
NP_001188503
NP_079428

NP_084036

Орналасқан жері (UCSC)Хр 14: 31.49 - 31.86 MbChr 12: 52.1 - 52.31 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

NUBPL темір-күкірт протеині (IND1) ретінде белгілі нуклеотидпен байланысатын ақуызға ұқсас (NUBPL), IND1 гомолог, Нуклеотидпен байланысатын ақуызға ұқсас немесе huInd1 темір күкірт (Fe / S) ақуыз адамдарда бұл кодталған NUBPL ген, орналасқан хромосома 14q 12. Митохондриялық кешен I құрастыру жолын құрастыруда ерте рөл атқарады.[5][6]

Құрылым

NUBPL орналасқан q қол туралы хромосома 14 позицияда 12 және 18-ге ие экзондар.[5] The NUBPL ген 54-тен тұратын 5,9 кДа ақуызын шығарады аминқышқылдары.[7][8] Ақуыздың құрылымына болжамды кіреді темір-күкіртті байланыстыру (CxxC) қолтаңбасы, а нуклеотидті байланыстыратын домен ол өте сақталған және а митохондриялық бағыттау реттілігі ішінде N-терминал.[9] NUBPL I эволюциялық жолмен сақталған 45 ішкі суббірліктен тұратын I кешенін құрастыру үшін қажет, оның екеуі де митохондриялық ДНҚ және ядролық кодталған суббірліктер. Оның бір қолы митохондрияның ішкі мембранасына, ал екіншісі органоид. Екі қол L-тәрізді конфигурацияда орналасқан. Барлығы молекулалық массасы кешеннің 1MDa құрайды.[10]

Функция

The NUBPL ген Mrp / NBP35 құрамына кіретін ақуызды кодтайды ATP - міндетті отбасы. Бұл ақуызды жинау үшін қажет митохондриялық мембрана тыныс алу тізбегі НАДХ дегидрогеназа (I комплекс), -ның алғашқы олигомерлі ферменттік кешені митохондриялық тыныс алу тізбегі орналасқан ішкі митохондриялық мембрана.[6][5] Оның құрастырудағы рөлі - бір немесе бірнеше жеткізу темір-күкірт (Fe-S) кластерлері in vitro анаэробты жағдайда күрделі I суббірліктерге.[6][9] NUBPL дисфункциясы белсенділіктің төмендеуіне әкелуі мүмкін I кешенінің перифериялық қолының дұрыс емес жиналуына әкеледі. Ақуыздың нокауны аномальды митохондрияны тудырады ультрақұрылым тыныс алуымен сипатталады суперкомплекс қайта құру, христа қабығы жоғалту және қалыптан тыс жоғары лактат деңгейлер.[11][9]

Ашу

Шефтель және т.б. (2009) қолданылған РНҚ интерференциясы (RNAi) ашытқыдағы NUBPL генін жою үшін (Липолитика ). Олар деңгейлер мен белсенділіктің төмендеуін байқады митохондриялық кешен I, оларды NUBPL күрделі I құрастыру және белсенділік үшін қажет деген қорытындыға әкеледі. Олардың эксперименттері NUBPL-дің ашытқы мен адамдардағы функционалды сақталуын көрсетті, бұл ақуыздың маңызды қызмет атқаратынын көрсетті. Шефтель және т.б. митохондрияларда құрылымдық ауытқулар байқалды, олар NUBPL-мен сарқылған митохондриялар болды.[9]

Клиникалық маңызы

NUBPL-тің болмауы митохондриялық кешен I құрастыру жолының алғашқы сатысын бұзады. NUBPL-ді жоятын клеткаларда I комплекстің мембраналық қолында қалыпты түрде кездесетін ақуыздардың аномальды суб-кешені бар екендігі байқалды, I күрделі суббірлік ақуыздардың азаюы, NDUFS1, NDUFV1, NDUFS3, және NDUFA13 қалыпты I құрастырудың істен шыққандығын көрсетті.[9] Митохондриялық кешеннің жетіспеушілігі, дисфункцияны қамтиды митохондриялық тыныс алу тізбегі леталды неонатальды аурудан бастап ересек адамның басталатын нейродегенеративті бұзылуларға дейінгі клиникалық көріністердің кең спектрін тудыруы мүмкін. Фенотиптерге жатады макроцефалия прогрессивті лейкодистрофия, арнайы емес энцефалопатия, кардиомиопатия, миопатия, бауыр ауруы, Лей синдромы, Лебер тұқым қуалайтын оптикалық нейропатия, және кейбір формалары Паркинсон ауруы.[6]

103-те нұсқаларды анықтау үшін жоғары өнімді ДНҚ секвенциясы қолданылды кандидаттардың гендері митохондриялық кешен 1 бұзылысы бар 103 пациентте. Гетерозиготалы NUBPL-дегі нұсқалар бір пациентте анықталды. кДНҚ толықтыру Зерттеулер нұсқалар күрделі 1 тапшылығын тудыруы мүмкін екенін көрсетті. Бұл пациенттің нәтижесі сәйкес келеді автозомдық рецессивті мұрагерлік NUBPL-мен байланысты I кешенінің жетіспеушілігі және анықталған нұсқалардың патогенділігін қолдайды.[11] Осы науқаста NUBPL генінде күрделі гетерозиготалық нұсқалар анықталды.[11] 2 экзонында патентальды түрде мұраланған G> A нүктесі мутация (c.166 G> A) нәтижесі миссенсті ауыстыру гли56-дан-арг (G56R) байқалды. Екі нұсқа болды аналық-мұрагерлік: T> C нүктелік мутация (c.815-27 T> C) сплайсинг қатесін және комплексті тудырды жою 1-4 және қайталау тарту экзон 7. 232 (1%) бақылау хромосомасының екеуінде c166 G> A патогендік нұсқасы бар екендігі анықталды. Бұл жеке тұлғаның қозғалтқыштың кідірісі болғандығы атап өтілді дамудың тежелуі 2 жаста[11] Ол ешқашан тәуелсіз жүруге қол жеткізе алмады. Ол дамыды миопатия, нистагм, атаксия, жоғарғы моторлы нейрон белгілері және болмауы ұстамалар. Мидың МРТ көрсетті лейкодистрофия қатысуымен церебральды қыртыс және терең ақ зат. 8 жасында ол болды спастизм, атаксия, және сөйлеу проблемалары.

Ерте келген бірнеше науқас МРТ аномалиялары мишық, терең ми ақ зат және кальций корпусы. Осы кішігірім үлгіде кейінгі бейнелеу зерттеулері жақсартуларды көрсеткені атап өтілді кальций корпусы және ми ақ заттар ауытқулар, ал церебральды ауытқулар нашарлайды және ми діңі ауытқулар пайда болады. Тұтас пайдалану экзомалық реттілік, пациенттердің төртеуінде митохондриялық кешеннің І жетіспеушілігі басқа зертханалық әдістердің көмегімен анықталған. Науқастардың төртеуінде де NUBPL генінің құрамдас патогенді нұсқалары болған.[12]

Өзара әрекеттесу

NUBPL-мен ақуыз-протеин әрекеттеседі DNAJB11, MTUS2, RNF2, және UFD1L.[6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б в GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000151413 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б в GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000035142 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ а б в «Entrez Gene: NUBPL нуклеотидті байланыстыратын ақуыз [Homo sapiens (адам)]». Алынған 2018-07-27.
  6. ^ а б в г. e «NUBPL - темір-күкірт протеині NUBPL - Homo sapiens (Human) - NUBPL гені мен ақуызы». www.uniprot.org. Алынған 2018-07-27.
  7. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS және басқалар. (Қазан 2013). «Жүрек протеомдарының биологиясы мен медицинасын мамандандырылған білім қорымен интеграциялау». Айналымды зерттеу. 113 (9): 1043–53. дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  8. ^ Яо, Даниэль. «Атлас жүрек протеиндері туралы білім қоры (COPaKB) - ақуыздар туралы ақпарат». amino.heartproteome.org. Алынған 2018-07-27.
  9. ^ а б в г. e Sheftel AD, Stehling O, Pierik AJ, Netz DJ, Kerscher S, Elsässer HP, Wittig I, Balk J, Brandt U, Lill R (қараша 2009). «Human ind1, I тыныс алу кешені үшін темір-күкірт кластерін құрастыру коэффициенті». Молекулалық және жасушалық биология. 29 (22): 6059–73. дои:10.1128 / mcb.00817-09. PMC  2772561. PMID  19752196.
  10. ^ Rhein VF, Carroll J, Ding S, Fearnley IM, Walker JE (шілде 2016). «NDUFAF5 гидроксилаттары NDUFS7 I кешенін алғашқы ассамблеяның алғашқы кезеңінде». Биологиялық химия журналы. 291 (28): 14851–60. дои:10.1074 / jbc.M116.734970. PMC  4938201. PMID  27226634.
  11. ^ а б в г. Calvo SE, Tucker EJ, Compton AG, Kirby DM, Crawford G, Burtt NP және т.б. (Қазан 2010). «Өткізгіштігі жоғары, жинақталған тізбектілік I комплексті жетіспеушілікте NUBPL және FOXRED1 мутациясын анықтайды». Табиғат генетикасы. 42 (10): 851–8. дои:10.1038 / нг.659. PMC  2977978. PMID  20818383.
  12. ^ Кевелам SH, Роденбург RJ, Қасқыр NI, Феррейра П, Лунсинг RJ, Нижтманс LG және т.б. (Сәуір 2013). «I күрделі жетіспеушілігі бар науқастарда NUBPL мутациясы және ерекше МРТ үлгісі». Неврология. 80 (17): 1577–83. дои:10.1212 / wnl.0b013e31828f1914. PMC  3662327. PMID  23553477.