SPEN - SPEN - Wikipedia

SPEN
Ақуыз SPEN PDB 1ow1.png
Қол жетімді құрылымдар
PDBОртологиялық іздеу: PDBe RCSB
Идентификаторлар
Бүркеншік аттарSPEN, HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, spen отбасылық транскрипциялық репрессор
Сыртқы жеке куәліктерOMIM: 613484 MGI: 1891706 HomoloGene: 124461 Ген-карталар: SPEN
Геннің орналасуы (адам)
1-хромосома (адам)
Хр.1-хромосома (адам)[1]
1-хромосома (адам)
SPEN үшін геномдық орналасу
SPEN үшін геномдық орналасу
Топ1p36.21-б36.13Бастау15,836,095 bp[1]
Соңы15,940,456 bp[1]
РНҚ экспрессиясы өрнек
PBB GE SPEN 201997 с fs.png сайтында
Қосымша сілтеме өрнегі туралы деректер
Ортологтар
ТүрлерАдамТышқан
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_015001

NM_019763
NM_001347235

RefSeq (ақуыз)

NP_055816

NP_001334164
NP_062737

Орналасқан жері (UCSC)Chr 1: 15.84 - 15.94 MbChr 4: 141.47 - 141.54 Mb
PubMed іздеу[3][4]
Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеуТінтуірді қарау / өңдеу

Msx2 өзара әрекеттесетін ақуыз Бұл ақуыз адамдарда кодталған SPEN ген.[5][6][7]

Бұл ген гормонды индукциялайтын транскрипциялық репрессорды кодтайды. Осы гендік өніммен транскрипцияны репрессиялау басқа репрессорлармен өзара әрекеттесу кезінде, гистон деацетилденуіне қатысатын ақуыздарды жинау арқылы немесе транскрипциялық активаторларды секвестрлеу арқылы жүруі мүмкін. Бұл геннің өнімі құрамында басқа корепрессор белоктарымен байланысуға мүмкіндік беретін карбокси-терминал домені бар. Бұл домен құрамында деацетилаза белсенділігі бар нуклеосоманы қайта құратын ақуыз кешені NuRD кешенінің мүшелерімен өзара әрекеттесуге мүмкіндік береді. Сонымен қатар, бұл репрессордың құрамында стероидты рецепторлы РНҚ коактиваторымен байланысатын бірнеше РНҚ тану мотивтері бар; бұл байланыс лигандталған және бейсыза стероидты рецепторлардың белсенділігін модуляциялай алады.[7]

Өзара әрекеттесу

SPEN көрсетілді өзара әрекеттесу бірге HDAC1,[6] SRA1[6] және Ядролық рецепторлардың қосалқы репрессоры 2.[6]

Әдебиеттер тізімі

  1. ^ а б c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000065526 - Ансамбль, Мамыр 2017
  2. ^ а б c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000040761 - Ансамбль, Мамыр 2017
  3. ^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  4. ^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
  5. ^ Newberry EP, Latifi T, Towler DA (қыркүйек 1999). «MSx2 байланыстыратын жаңа протеин MINT-нің RRM домені егеуқұйрықтардың остеокальцин промоторын таниды және реттейді». Биохимия. 38 (33): 10678–90. дои:10.1021 / bi990967j. PMID  10451362.
  6. ^ а б c г. Ши Ю, Даунс М, Сэ В, Као Х.Й., Ордентлич П, Цай CC, Хон М, Эванс RM (мамыр 2001). «Өткір, ядролық рецепторлардың репрессиясы мен активациясын біріктіретін индуктивті кофактор». Genes Dev. 15 (9): 1140–51. дои:10.1101 / gad.871201. PMC  312688. PMID  11331609.
  7. ^ а б «Entrez Gene: SPEN spen гомологы, транскрипциялық реттегіш (Drosophila)».

Әрі қарай оқу