WBP11 - WBP11

WBP11
Қол жетімді құрылымдар
PDB	Ортологиялық іздеу: PDBe RCSB
PDB идентификатор кодтарының тізімі
	1JMQ, 1K5R
Идентификаторлар
Бүркеншік аттар	WBP11, NPWBP, PPP1R165, SIPP1, WBP-11, WW доменді байланыстыратын ақуыз 11, CFAP90, BUG13, FAP90
Сыртқы жеке куәліктер	OMIM: 618083 MGI: 1891823 HomoloGene: 134037 Ген-карталар: WBP11
Геннің орналасуы (адам)
Хр.	12-хромосома (адам)
Соңы	14,803,486 bp
Геннің орналасуы (тышқан)
Хр.	6-хромосома (тышқан)
Соңы	136,828,233 bp
Гендік онтология
Молекулалық функция	• бір тізбекті ДНҚ байланысы; • GO: 0001948 ақуыздармен байланысуы; • WW доменін байланыстыру; • РНҚ байланысы; • ақуыз фосфатаза реттегішінің белсенділігі;
Ұялы компонент	• ядролық дақ; • сплизеозомдық кешен; • жасушаішілік мембранамен шектелген органоид; • жасуша ядросы; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • цитозол;
Биологиялық процесс	• рРНҚ өңдеу; • mRNA цисінің қосылуы, сплитеосома арқылы; • мРНҚ өңдеу; • РНҚ өңдеу; • GO: 0048552 каталитикалық белсенділікті реттеу; • митохондрияның аутофагиясын реттеу; • РНҚ қосылуы; • митохондрияға бағытталған ақуыздың оң реттелуі; • мРНҚ-ны бөлу, сплитеосома арқылы;
	Дереккөздер:Амиго / QuickGO
Ортологтар
	51729
	60321
	ENSG00000084463
	ENSMUSG00000030216
	Q9Y2W2
	Q923D5
	NM_016312
	NM_021714
	NP_057396
	NP_068360
	Уикидеректер
Адамды қарау / өңдеу	Тінтуірді қарау / өңдеу

Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

Wbp11
Идентификаторлар
Таңба	Wbp11
Pfam	PF09429
InterPro	IPR019007
Қол жетімді ақуыз құрылымдары:
Pfam	құрылымдар / ЭКОД
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	құрылымның қысқаша мазмұны

Балама атаулар

WW байланысатын ақуыз 11 (WBP11)
Npw38 байланыстыратын ақуыз (NpwBP)
PQBP-1 және PP1-мен (SIPP1) өзара әрекеттесетін қосылу коэффициенті
SH3 доменімен байланысатын ақуыз, 70 кДа (SNP70)

Функция

Зерттеулер Wbp11 жасушаның бөлінуіне байланысты ДНҚ / РНҚ транскрипциялық немесе транскрипциядан кейінгі оқиғаларда рөл атқарады деп болжайды.^[5] Wbp11 ядрода кездеседі, бірақ интерфазадағы жасушалардың ядрошықтарында болмайды. Алайда ол бөлінетін жасушаларда бүкіл цитоплазмаға таралады.^[6] Иммуноэлектронды-микроскопиялық тәжірибелер жасуша бөлінуіндегі митоздың басталуымен сәйкес келетін пери-ядролықтан цитоплазмалық таралуға ауысуды ұсынады. Басқа зерттеулер Wbp11 сплитеосоманың құрамдас бөлігі екенін көрсетті. Сондай-ақ, Wbp11 фрагменттері мРНҚ-ға дейінгі сплайсинг катализін тежейді.^[7]

Ақуыздардың өзара әрекеттесуі

Wbp11 - бұл полипептид, ол белоктардың басқа WW доменімен, мысалы Npw38 ядролық протеинмен, екі пролинге бай аймақ арқылы әрекеттесетіні белгілі. Ол ядролардағы Npw38 (демек NpwBP) және Poly (rG) және G-ге бай ssDNA-мен байланысады.^[5] 70kDa ақуызының SH3 (Src гомология домені 3) домендерімен өзара әрекеттесуі де анықталды. Npw38 WW доменімен байланысатын S-терминалының пролинге бай тізбектері, классикалық I типке де, SH3 типті байланыстыру дәйектілігімен де сәйкес келеді, демек (SNP70).

Wbp11 p47phox таңбалы SH3 домендерімен және p47phox N-терминал SH3 доменімен, ал әлсізірек SH-домендермен c-src және p85α домендерімен күшті байланысатыны анықталды. p47phox.^[6]

Сонымен қатар, ол PP1 (протеин фосфотаза 1) -мен өзара әрекеттесетіні дәлелденді, демек SIPP1 деп аталды. Ол PP1-ге тежегіш әсер етеді, оның ингибирлеу потенциалы CK1 ақуыз киназасымен фосфорлану кезінде жоғарылайды. Wbp11-ді PP1-мен байланыстыру үшін PP1 интеракторларының көпшілігінде PP1- байланыстыру реті ретінде қызмет ететін RVXF (Arg-Val-Xaa-Phe) мотиві қажет.^[7]

Басқа бірқатар өзара әрекеттесулер көрсетілген:

Виментин ^[6]
Өсу факторы рецепторларымен байланысқан 2 (GRB2) ^[8]
Геном полипротеині ^[9]
Тирозин-ақуыз киназасы Fyn ^[8]
МРНҚ алдын-ала өңдеу коэффициенті 39 (PRP39) ^[10]
TNF рецепторымен байланысты фактор 4 (TRAF4) ^[8]
Кальциневин B гомологиялық ақуыз 3 (TESC) ^[8]
Ықтимал ATP-тәуелді РНҚ геликаза DDX17 ^[11]
CD2 антигенін цитоплазмалық құйрықты байланыстыратын ақуыз 2 (CD2BP2) ^[12]
Поли (rC) байланыстыратын ақуыз 1 (PCBP1) ^[13]

Пайдаланылған әдебиеттер

^ ^а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000084463 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000030216 - Ансамбль, Мамыр 2017
^ «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.
^ ^а ^б Комуро А, Саеки М, Като С (желтоқсан 1999). «Екі ядролық ақуыздың, Npw38 және NpwBP ассоциациясы, WW домені мен глицин мен аргинині бар жаңа пролинге бай мотивтің өзара әрекеттесуі арқылы». Биологиялық химия журналы. 274 (51): 36513–9. дои:10.1074 / jbc.274.51.36513. PMID 10593949.
^ ^а ^б ^c Craggs G, Finan PM, Lawson D, Wingfield J, Perera T, Gadher S, Totty NF, Kellie S (тамыз 2001). «MRNA сплайсинг факторларымен және аралық жіпшелерден тұратын перинуклеарлы желілермен коолализирленген ядролық SH3 доменді байланыстыратын ақуыз» (PDF). Биологиялық химия журналы. 276 (32): 30552–60. дои:10.1074 / jbc.M103142200. PMID 11375989. S2CID 21245372.
^ ^а ^б Llorian M, Beullens M, Andrés I, Ortiz JM, Bollen M (ақпан 2004). «SIPP1, мРНҚ-ға дейінгі жаңа сплайсинг факторы және фосфатаза-1 ақуызының интеракторы». Биохимиялық журнал. 378 (Pt 1): 229-38. дои:10.1042 / BJ20030950. PMC 1223944. PMID 14640981.
^ ^а ^б ^c ^г. Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N және т.б. (Қараша 2014). «Адамның интерактомдық желісінің протеома масштабты картасы». Ұяшық. 159 (5): 1212–26. дои:10.1016 / j.cell.2014.10.050. PMC 4266588. PMID 25416956.
^ Dolan PT, Zhang C, Khadka S, Arumugaswami V, Vangeloff AD, Heaton NS, Sahasrabudhe S, Randall G, Sun R, LaCount DJ (желтоқсан 2013). «С гепатиті вирусының иесі бар жасуша ақуыздарының өзара әрекеттесуін анықтау және салыстырмалы талдау». Молекулалық биожүйелер. 9 (12): 3199–209. дои:10.1039 / c3mb70343f. PMC 4171131. PMID 24136289.
^ Zhong Q, Pevzner SJ, Hao T, Wang Y, Mosca R, Menche J және т.б. (Сәуір 2016). «Үлкен эволюциялық қашықтықтағы ақуыздар мен ақуыздардың өзара байланыс желісі». Молекулалық жүйелер биологиясы. 12 (4): 865. дои:10.15252 / msb.20156484. PMC 4848758. PMID 27107014.
^ Hegele A, Kamburov A, Grossmann A, Sourlis C, Wowro S, Weimann M, Will CL, Pena V, Lührmann R, Stelzl U (ақпан 2012). «Адамның сплитеосомасының протеин-протеинмен өзара әрекеттесетін сымдары». Молекулалық жасуша. 45 (4): 567–80. дои:10.1016 / j.molcel.2011.12.034. PMID 22365833.
^ Кофлер М, Мотцни К, Бейерман М, Фрейнд С (қыркүйек 2005). «CD2BP2-GYF доменінің өзара әрекеттесуінің жаңа серіктестері». Биологиялық химия журналы. 280 (39): 33397–402. дои:10.1074 / jbc.M503989200. PMID 16000308.
^ Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (мамыр 2006). «Адамның тұқым қуалайтын атаксиялары мен Пуркинье жасушаларының деградациясының бұзылыстары үшін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Ұяшық. 125 (4): 801–14. дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.

Бұл мақалада көпшілікке арналған мәтін енгізілген Pfam және InterPro: IPR019007

Бұл ақуыз - қатысты мақала а бұта. Сіз Уикипедияға көмектесе аласыз оны кеңейту.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c GRCh38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSG00000084463 - Ансамбль, Мамыр 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: Ансамбльдің шығарылымы 89: ENSMUSG00000030216 - Ансамбль, Мамыр 2017

[3] «Адамның PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[4] «Mouse PubMed анықтамасы:». Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы, АҚШ Ұлттық медицина кітапханасы.

[:0-5] а ^б Комуро А, Саеки М, Като С (желтоқсан 1999). «Екі ядролық ақуыздың, Npw38 және NpwBP ассоциациясы, WW домені мен глицин мен аргинині бар жаңа пролинге бай мотивтің өзара әрекеттесуі арқылы». Биологиялық химия журналы. 274 (51): 36513–9. дои:10.1074 / jbc.274.51.36513. PMID 10593949.

[:1-6] а ^б ^c Craggs G, Finan PM, Lawson D, Wingfield J, Perera T, Gadher S, Totty NF, Kellie S (тамыз 2001). «MRNA сплайсинг факторларымен және аралық жіпшелерден тұратын перинуклеарлы желілермен коолализирленген ядролық SH3 доменді байланыстыратын ақуыз» (PDF). Биологиялық химия журналы. 276 (32): 30552–60. дои:10.1074 / jbc.M103142200. PMID 11375989. S2CID 21245372.

[:2-7] а ^б Llorian M, Beullens M, Andrés I, Ortiz JM, Bollen M (ақпан 2004). «SIPP1, мРНҚ-ға дейінгі жаңа сплайсинг факторы және фосфатаза-1 ақуызының интеракторы». Биохимиялық журнал. 378 (Pt 1): 229-38. дои:10.1042 / BJ20030950. PMC 1223944. PMID 14640981.

[:3-8] а ^б ^c ^г. Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N және т.б. (Қараша 2014). «Адамның интерактомдық желісінің протеома масштабты картасы». Ұяшық. 159 (5): 1212–26. дои:10.1016 / j.cell.2014.10.050. PMC 4266588. PMID 25416956.

[9] Dolan PT, Zhang C, Khadka S, Arumugaswami V, Vangeloff AD, Heaton NS, Sahasrabudhe S, Randall G, Sun R, LaCount DJ (желтоқсан 2013). «С гепатиті вирусының иесі бар жасуша ақуыздарының өзара әрекеттесуін анықтау және салыстырмалы талдау». Молекулалық биожүйелер. 9 (12): 3199–209. дои:10.1039 / c3mb70343f. PMC 4171131. PMID 24136289.

[10] Zhong Q, Pevzner SJ, Hao T, Wang Y, Mosca R, Menche J және т.б. (Сәуір 2016). «Үлкен эволюциялық қашықтықтағы ақуыздар мен ақуыздардың өзара байланыс желісі». Молекулалық жүйелер биологиясы. 12 (4): 865. дои:10.15252 / msb.20156484. PMC 4848758. PMID 27107014.

[11] Hegele A, Kamburov A, Grossmann A, Sourlis C, Wowro S, Weimann M, Will CL, Pena V, Lührmann R, Stelzl U (ақпан 2012). «Адамның сплитеосомасының протеин-протеинмен өзара әрекеттесетін сымдары». Молекулалық жасуша. 45 (4): 567–80. дои:10.1016 / j.molcel.2011.12.034. PMID 22365833.

[12] Кофлер М, Мотцни К, Бейерман М, Фрейнд С (қыркүйек 2005). «CD2BP2-GYF доменінің өзара әрекеттесуінің жаңа серіктестері». Биологиялық химия журналы. 280 (39): 33397–402. дои:10.1074 / jbc.M503989200. PMID 16000308.

[13] Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (мамыр 2006). «Адамның тұқым қуалайтын атаксиялары мен Пуркинье жасушаларының деградациясының бұзылыстары үшін ақуыз-ақуыздың өзара әрекеттесуі». Ұяшық. 125 (4): 801–14. дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]